MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum WCFS1 plasmid pWCFS103

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006377	CTA	2	6	76	81	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006377	TAC	2	6	88	93	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006377	TTC	2	6	210	215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006377	TTG	2	6	611	616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006377	A	6	6	679	684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006377	A	6	6	712	717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006377	T	6	6	743	748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006377	GGC	2	6	775	780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006377	T	6	6	828	833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006377	A	6	6	850	855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006377	GAAA	2	8	891	898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006377	CTA	3	9	1340	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006377	TCG	2	6	1365	1370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006377	ACC	2	6	1414	1419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_006377	CTA	2	6	1451	1456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006377	A	6	6	1456	1461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006377	TAG	2	6	1467	1472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006377	TGTT	2	8	1493	1500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006377	ACC	2	6	1544	1549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_006377	CAC	2	6	1578	1583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_006377	TTG	2	6	1602	1607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006377	ATA	2	6	1709	1714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006377	GGTG	2	8	1761	1768	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006377	T	7	7	1769	1775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006377	GTT	2	6	1806	1811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006377	GAA	2	6	1956	1961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006377	ATC	2	6	2003	2008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006377	GAC	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006377	CA	3	6	3281	3286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006377	A	6	6	3286	3291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006377	TAT	2	6	3298	3303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006377	TACA	2	8	3332	3339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_006377	GTA	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006377	TAAA	2	8	3727	3734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006377	TAA	2	6	3752	3757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006377	ATTA	2	8	3781	3788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006377	TTAT	2	8	4383	4390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006377	A	6	6	4437	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006377	GAAG	2	8	4582	4589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006377	ATCGA	2	10	4603	4612	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_006377	AAG	2	6	4618	4623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006377	AAC	2	6	4869	4874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006377	AAT	2	6	4875	4880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006377	A	6	6	4976	4981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006377	A	6	6	4996	5001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006377	ATA	2	6	5010	5015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006377	T	6	6	5052	5057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006377	AAT	2	6	5128	5133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006377	GCC	2	6	5181	5186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_006377	A	6	6	5278	5283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006377	GAA	2	6	5293	5298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006377	ATT	2	6	5303	5308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006377	TGC	2	6	5328	5333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006377	TATTT	2	10	5334	5343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006377	TAT	2	6	5657	5662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006377	TA	4	8	6465	6472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006377	GAG	2	6	6492	6497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006377	GGA	2	6	8285	8290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006377	AATT	2	8	10271	10278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006377	AATT	2	8	11684	11691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006377	AAC	2	6	11704	11709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006377	ATT	2	6	11718	11723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006377	CTA	2	6	11735	11740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_006377	GGC	2	6	11784	11789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006377	TCT	2	6	11845	11850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006377	ATTAA	2	10	11856	11865	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006377	TGAATA	2	12	11901	11912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006377	T	6	6	11953	11958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006377	AAATT	2	10	11964	11973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006377	ACA	2	6	11978	11983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006377	TAA	2	6	12010	12015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006377	GAG	2	6	12018	12023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006377	TTGT	2	8	14152	14159	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006377	T	6	6	14197	14202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006377	GTT	2	6	14658	14663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006377	TCC	2	6	18558	18563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_006377	CCT	2	6	28102	28107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_006377	TGT	2	6	28110	28115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006377	TTG	2	6	28116	28121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006377	ATTT	2	8	28502	28509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006377	T	8	8	28507	28514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006377	TGT	2	6	30624	30629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006377	ACA	2	6	30671	30676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006377	CTG	2	6	30725	30730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006377	ATT	2	6	30826	30831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006377	ATA	2	6	31698	31703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006377	TTG	2	6	31704	31709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006377	CTT	2	6	31725	31730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_006377	CGA	2	6	31778	31783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006377	T	6	6	32481	32486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006377	TAT	2	6	32526	32531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006377	T	6	6	32620	32625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006377	AAT	2	6	32639	32644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006377	AAAG	2	8	35699	35706	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006377	A	6	6	35714	35719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006377	T	6	6	35750	35755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006377	TCT	2	6	35945	35950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006377	CAA	2	6	35988	35993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006377	ATC	2	6	36061	36066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.